限制性核酸内切酶是可以识别特定的核苷酸序列，并在每条链中特定部位的两个核苷酸之间的磷酸二酯键进行切割的一类酶，简称限制酶、�/span>

一般是以微生物属名的第一个字母和种名的前两个字母组成，第四个字母表示菌株(品系)。例如，从Bacillus amylolique faciens H中提取的限制性内切酶称为Bam H，在同一品系细菌中得到的识别不同碱基顺序的几种不同特异性的酶，可以编成不同的号，如HindⅡ、HindⅢ，HpaI、HpaⅡ，MboI、MboⅡ等、�br/> 再如EcoRI９�/span>

根据限制酶的结构，辅因子的需求切位与作用方式，可将限制酶分为三种类型，分别是第一�?Type I)、第二型(Type �?及第三型(Type �?、�br/> 1、第一型限制酶
同时具有修饰(modification)及识别切�?restriction)的作用；另有识别(recognize)DNA上特定碱基序列的能力，通常其切割位(cleavage site)距离识别�?recognition site)可达数千个碱基之远。例如：EcoB、EcoK、�br/> 2、第二型限制酵�br/> 只具有识别切割的作用，修饰作用由其他酶进行。所识别的位置多为短的回文序�?palindrome sequence)；所剪切的碱基序列通常即为所识别的序列。是遗传工程上，实用性较高的限制酶种类。例如：EcoRI、HindⅢ、�br/> 3、第三型限制酵�br/> 与第一型限制酶类似，同时具有修饰及识别切割的作用。可识别短的不对称序列，切割位与识别序列约距24-26个碱基对。例如：HinfⅢ、�/span>

限制性核酸内切酶分布极广，几乎在所有细菌的属、种中都发现至少一种限制性内切酶，多者在一属中就有几十种，例如在嗜血杆菌属中(Haemophilus)现已发现的就�?2种。有的菌株含酶量极低，很难分离定性；然而在有的菌株中，酶含量极高．如E. coli的pMB4(EcoRI�?和H. aegyptius(Hal Ⅲ酶)就是高产酶菌株。据报道�?0g的H. aegyptius的细胞中，能分离提纯出可消化l0gλ噬茵体DNA的酶量。到目前为止，细菌是限制性内切酶，尤其是特异性非常强的I类限制性内切酶的主要来源、�/span>