5-氟胞嘧啶对隐藏球菌属、念珠菌属有较高的抗真菌活性，对芽生菌属，分枝芽胞菌属、某些着色真菌属、曲菌属也有抗菌少万籁 。本品低浓度时抑菌，高浓度时具有杀菌作用。作用机制为阻断真菌核酸合成。真菌对本品易产生耐药性。